五月十日，刘骏进入建康，正式坐拥南朝，同时大赦天下。为了坐稳江山，获取国内支持，刘骏对参与平叛的以及拥戴他的文武百官和将士皆赐爵位；对年迈、鳏夫寡妇、孤儿、病残、不能生存的百姓，每人赐谷五斛；陈租旧债不再征收，被罚服长期劳役的尽量宽恕。刘骏即位伊始，还采取了一系列稳固局势的措施，以沈庆之、柳元景、宗悫分掌领军将军、左卫将军、右卫将军，组建新的中央禁军；为刘义恭、刘义宣、刘诞、刘宏、刘祎等进号加爵，以安抚皇族宗室；任命刘秀之、朱修之、垣护之、申恬、庞秀之等颇有才能的大臣出任益、雍、冀、青、梁、南秦、兖等各边州刺史，以稳定边州地方局势；派遣大使十五人巡视地方各州郡，了解地方民情，消除刘劭对地方的影响，加强对地方军政的控制；登基之初仍使用父皇刘义隆的“元嘉”年号，改立刘义隆庙号“太祖”，谥号“文皇帝”，以彰显自己延续文帝皇统的合法性。刘宋朝正式进入了一个新的时期。

　　然而好景不长，帝位还没有坐稳的刘骏，却迎来了一次大规模的叛乱，而这次叛乱的源头却是曾经与北魏太武帝拓跋焘互怼，并且用一坛尿气的拓跋焘差点吐血，有大功于社稷的刺头臧质。

　　臧质外戚出身，其父臧熹乃是刘裕爱妻臧爱亲的幼弟，很得刘裕与臧爱亲的疼爱，后来在征战谯蜀时病故，刘裕大为悲痛，不但予以追封，同时让其子臧质袭爵。臧质生性放荡，喜爱田猎与博戏，不受文帝刘义隆的待见，因为刘裕嫡长女会稽长公主刘兴娣的缘故才得到重用，但屡次失职，导致仕途浮浮沉沉。但是当年拓跋焘南侵时，臧质镇守盱眙有大功，获封雍州刺史。

　　刘劭弑父登位后，为了笼络这位实力派舅舅，特加封他为征虏将军。但是臧质从建康的家人口中得知事变的真相，顿时大惊失色，同时他又感到攫取大权的时机来了，于是率五千士卒南下荆州投奔刘义宣，打算拥立他为主。其实臧质之所以没有投奔刘骏是有他的算计的，他一方面认为自己跟刘义宣是同辈，关系比较亲厚，而且还是儿女亲家，另一方面他觉得刘义宣的能力要弱于刘骏，将来好控制。

　　臧质来到江陵，见到刘义宣后，立刻行跪拜大礼。刘义宣大惊，虽说自己是藩王，但臧质跟自己是同辈，并且比自己大十几岁，如此跪拜太不合礼数，于是刘义宣连忙扶起，错愕的问道：“表兄如何能向愚弟行此大礼啊！”。臧质此时也不太好明言，只能含糊其辞道“理应如此”。两人一番交谈，臧质才知道此时刘义宣因为刘骏是先帝子嗣所以遣使拥戴他为盟主了。臧质大感失望，但也无可奈何，只得受刘义宣之命为征北将军，并赶往刘骏军前效力。

　　臧质在建康之战中，与薛安都、程天祚一起攻打台城活捉了刘劭，因此立得大功，获封江州刺史、车骑将军、始兴郡公、开府仪同三司。但臧质对于这个后辈皇帝始终不服气，又认为自己有大功于社稷，所以行事专断，蛮横霸道，甚至挪用公银，完全不把朝廷放在眼里，因此数次被孝武帝刘骏遣使训斥。

　　臧质怀恨在心，又感到害怕，于是亲自来到荆州，邀刘义宣造反。

　　“自古以来，获得无法赏赐之大功，挟震主之威势者，能有几个可以善终的？大王正是如此，如今天下皆归心于大王，如果不能果断行事，到时必有杀身之祸，希望大王能早下决断！”一番试探后，臧质终于说出了来意，他顿了顿，继续言道：“兖州刺史徐遗宝曾是大王的家臣，豫州刺史鲁爽曾跟您一起讨伐叛逆刘劭，他们都会为大王效死力的，而我自然也会率江州大军，乘九江楼船为大王担任先锋，直驱石头城下！到时半壁江山为大王所有，而天子倚重的沈庆之、柳元景曾与我并肩北伐，交情深厚，必不会为天子所用，大王只要率八州之师西进，哪怕韩信、白起复生也不可能会有作为了。况且天子失德天下皆知，世间难留者是时光，不可错失者是机会，我常担心自己会先死，没机会为大王效力于马前，大王机不可失啊！”。

　　就在鲁爽长篇大论、滔滔不绝的鼓动时，刘义宣一直沉默不语，其实他本身也是个极具野心的藩王，而且跟刘骏之间也有矛盾。

　　之前讨平刘劭后，刘骏担心荆州位置特殊，已经坐镇十余年的刘义宣再镇守下去会形成祸患，所以打算调他做扬、豫二州刺史，但是被刘义宣拒绝，羽翼未丰的刘骏只好妥协，同时封刘义宣为侍中、使持节、丞相如故，拜为荆、湘二州刺史，同时都督荆、湘、雍、益、梁、宁、南北秦八州诸军事，改封南郡王，食邑万户。这看似无以复加的封赐，其实也是对刘义宣产生了警惕。刘义宣当然明白其间道理，摆在他面前的要不是急流勇退，要不就是灾祸临头。而且近来建康传言，刘骏竟然与刘义宣留在建康的女儿私通，这让他更加怒不可遏！

　　刘义宣的近臣蔡超、竺超民等也都怂恿刘义宣起兵，以求能得到更大的富贵。刘义宣思虑良久后终于同意起兵，并让臧质回到江州等待消息，同时秘密整顿战船、兵甲，并致信给鲁爽、徐遗宝，约定于孝建元年秋季一同举兵。

　　好巧不巧，当刘义宣的密信送到鲁爽手中时，鲁爽正在与属下喝酒喝得兴高采烈，鲁爽当众拆开密信观看，看着看着眼睛睁圆，片刻后一拍酒案，大呼道：“反了、反了，本将要反了！”。

　　众人听完，不知何意，半晌无人说话，鲁爽接着说道：“南郡王约我起兵攻打建康，本将与南郡王相交深厚，当然义不容辞，决定反了！”。

　　众人听完，立刻大惊，当场就有数人离席逃走。事已至此，鲁爽第二天只得宣布起兵南下，并命令部众举起黄旗，改称年号为建平元年，私自制造法服，登上法坛，自加称号。又将前晚离席而走的长史韦处穆、中兵参军杨元驹、治中庾腾之斩杀。之后鲁爽又将所制的车舆冠服与各种仪仗送往江陵，下文书宣告义宣和臧质等一并起兵，文书写道“丞相刘补天子，名义宣，车骑臧今补丞相，名质，平西朱今补车骑，名修之，皆版到奉行。”。

　　仪仗、文书送到江陵后，刘义宣惊愕，知道事情败露，无奈之下没有准备充分便仓皇起兵，于是臧质，徐遗宝也一同宣布起兵。

　　起兵的四州叛军以清君侧的名义发兵建康，消息传来，刘骏惊惧不已，感到朝廷的实力无法与之对抗，甚至打算“退位让贤”，派车驾迎接刘义宣进京登基。但被其弟竟陵王刘诞劝阻。刘骏随即平静下来，开始布置军力平叛。孝武帝刘骏命令辅国将军王玄谟率水军据守梁山洲，并在附近江边两岸修筑偃月垒，水陆列阵以待江州军。抚军将军柳元景则屯兵姑孰，作为王玄谟的后继。

　　与此同时，刘义宣为了争取到更多地方势力的支持，下令将全国刺史、郡守统统加官进爵！并派人至各处联络共同发兵，雍州刺史朱修之假意答应，暗中却让人去建康表达忠心，益州刺史刘秀之直接就斩杀了刘义宣的使者，并发兵一万沿江而下攻打江陵，牵制叛军。

　　刘义宣让朱修之南下阻击刘秀之，但朱修之迟迟不动，刘义宣知道了朱修之真正的意图，于是分兵一万让鲁爽之弟鲁秀攻打朱修之。

　　徐遗宝南下的时候约自己的姐夫青州刺史、宁远将军垣护之一同起兵攻打彭城，这位当年第二次北伐率小舟冲破北魏黄河防线的名将当然不会同意，反而与彭城守军一起夹击徐遗宝，徐遗宝战败，率残兵投奔鲁爽。

　　很快四路叛军人马即将合兵一处，但是鲁爽与徐遗宝赶到历城时，与孝武帝刘骏派出的左将军薛安都相遇了，鲁爽自持自己万人敌，于是上前挑战，但是嗜酒如命的他，不久前才喝的酩酊大醉，而且薛安都也是当世猛将，当年北伐时，陕城一战，他单骑杀得北魏骑兵丢盔弃甲。两人交战，只十几回合下来，酒醉的鲁爽便被薛安都刺伤坠马，身边的部将范双见到后，为了邀功，连忙上前斩下主子首级，鲁爽一死，军心大乱，纷纷弃械归降，朝廷军队很快平定了寿阳，鲁爽的子弟全部被杀。徐遗宝乘乱逃奔东海郡，但是被当地驻军斩杀。

　　相约反叛的四路大军，没过多久两路就已灭亡，这使得刘义宣、臧质感到恐慌。而这时建康城中的刘义恭遣人送了一封信给刘义宣“当年殷仲堪将兵权交给桓玄，结果桓玄转身便杀了殷仲堪一族；王恭对刘牢之信任至极，可是刘牢之却暗中加害。臧质为人，从小就不讲信义，六弟你应该非常清楚才对，如今臧质借着你荆州军民强盛，图谋私利，如果被他得逞，他可不会是池中之物啊！”。

　　刘义宣看完五哥的书信后深以为然，开始不信任臧质，很快刘义宣与臧质联军到达姑熟，臧质针对朝廷的军力部署，建议刘义宣分兵进攻姑孰、梁山，以牵制柳元景与王玄谟，自己则亲率水军沿着外江直趋石头城，进逼建康。但刘义宣的亲信刘谌之却认为应先集中兵力攻取梁山，再长驱直取建康，还提醒刘义宣要提防臧质。本来就开始疑心臧质的刘义宣遂拒绝了臧质的建议，命他出兵强攻梁山。

　　这时驻扎梁山，督领朝廷诸将的人正是当年北伐之时阿谀奉承、纸上谈兵的王玄谟，面对臧质的进攻，王玄谟不敢出击，导致秦淮河西岸的营垒尽被叛军占领，很快臧质再攻梁山，王玄谟正要溃败之时，幸好垣护之及时率水师赶到。

　　一番激战后，臧质不敌，这时王玄谟总算是抓住了机会，立刻尽遣精兵出垒迎战，在薛安都、垣护之、宗越等部的奋击下，最终大败臧质。就此朝廷大军驻扎秦淮河东岸，叛军联军驻扎西岸。

　　但当时梁山附近的朝廷兵力只有一万多人，比叛军少了近十倍，王玄谟感到害怕，打算南下姑熟与在此驻扎的柳元景汇合，其实又是打算逃跑的节奏。垣护之当年北伐时就是王玄谟先锋大军中的部将，早知他的为人，于是让人快马加鞭带信给柳元景说道“叛军以为姑熟有精兵三万，其实只有数千，如果全军前往支援王玄谟，则必被叛军获知我兵力不足，而王玄谟绝不能后撤，一旦后撤，梁山必失，京师危已，我认为将军可以先做疑兵，然后分兵救援王玄谟。”。

　　柳元景在垣护之的提醒下，拒绝王玄谟投奔的企图，再留老弱守城，选取精锐士卒支援梁山，并沿途广插旗帜虚张声势。梁山守军以为是建康援军大至，军心安定，而叛军见此却开始惶恐不安。

　　数日后，臧质提出再攻梁山，刘义宣依然不放心他单独领兵，于是让心腹刘谌之于他一同出兵。这一战，薛安都再次大发神威，亲率骑兵突入叛军阵中，斩下刘谌之首级，叛军因此溃不成军！

　　垣护之还顺风放火，将臧质军中的船只全部烧毁。火势在风力的推动下很快便覆盖了整个江面，逐渐蔓延到西岸，将刘义宣所部营寨也烧毁殆尽。宋军乘着火势，纵兵出击。当时，臧质还想和刘义宣商讨后续行动，但刘义宣却早已逃走。他顿时气的大骂，但也手足无措，只得也弃军而逃。

　　臧质逃回浔阳，纵火烧毁府邸，命宠臣何文敬领兵在前，自己带着姬妾一路向西，逃到西阳。西阳太守鲁方平本是臧质党羽，见臧质兵败便起了背叛之心。他故意欺骗何文敬，称朝廷有诏“只诛首恶，不问其余”。何文敬遂抛弃臧质，独自逃走。臧质只得改奔武昌，打算投靠妹夫羊冲，但到后方才得知羊冲已经被杀。

　　臧质此时已是无处可逃，只得躲到南湖一带，饿得摘莲子充饥。不久，宋军追兵赶到，臧质被迫潜入湖中，以莲叶遮挡头部，仅将鼻子露出水面呼吸，但最终还是被追兵发现。他先是被一箭射中心脏，随后被乱刀砍死在湖中，连肠子都流淌了出来，与水草缠绕在一起。这位曾经令北魏太武帝拓跋焘气的发狂的名将，终于因叛乱而身死，时年五十五岁。孝武帝刘骏将他的首级用漆封住，放在武库中，作为后人鉴戒，并将他的子孙、党羽斩首弃市。

　　再说当时被刘义宣派出攻打朱修之的鲁秀在马鞍山被打的大败，率残兵逃回江陵，修整后打算东进追上刘义宣，谁知不久兄长鲁爽被杀，刘义宣兵败的消息相继传回了江陵。

　　刘义宣兵败，逃往荆州，一路上士卒溃散，回到江陵只剩十几人。鲁秀、竺超民等将领认为江陵还有兵卒万余，尚有东山再起的希望，便想召集余众与朝廷军再决胜负。但刘义宣已被大败打击得一蹶不振，终日失魂落魄，躲在后宅再也不肯出来。本就不稳的军心因此更加动摇，士卒们纷纷逃散。鲁秀也心灰意冷，出城北逃。刘义宣自忖无法自存，便想随鲁秀一同北去。他改穿戎装，带上儿子刘慆及五个爱妾，骑着马出府而去。

　　但是此时江陵已是一片混乱，到处都是乱兵，刘义宣不慎摔下马来，好不容易出城了，但是再也找不到鲁秀的踪影，无奈返回城中。此时刘义宣已经士卒离散，身边没有几个人了。第二日，刘义宣让身边的宦官去找自己的亲信竺超民，而竺超民见刘义宣事败，就打算抓住他向朝廷邀功，于是假意用车接刘义宣等人，实际上将他们送进了监牢之中，并派人通知朝廷，并让刘义宣在牢里等候朝廷降罪。

　　刘义宣极好渔色，每日离不开美女，他的王府蓄养上千嫔媵美姬，还有数十个尼姑、三十名男宠，是个男女通吃之徒。之前逃往时还带着最美的五名姬妾，抓入监牢后，五人依然跟随左右。不久五名姬妾都被放出，刘义宣大声哭道：“往日的逃亡颠沛不算是苦，如今跟爱妾分别才是真正的痛苦啊！”。

　　刘骏原来考虑到刘义宣是自己叔父，当年拥护自己对抗刘劭，也是有功之人，所以派人去让他自尽，想给他一点体面。可是朝廷新任命的荆州刺史朱修之带兵先来到了江陵，他将刘义宣一家全部斩首，刘义宣死时正好四十岁。这位朱修之正是朱序之孙，就是当年面对北魏十万大军，坚守滑台数月，然后刺杀拓跋焘不成，又从北燕南渡归朝的传奇人物。

　　孝武帝登基之初的一场叛乱就此平息，但是这场叛乱却为将来刘骏治国的方向产生了巨大影响！