那天晚上负责守卫城门的是司直田仁，刘屈氂责怪他没有关闭城门，以至于让太子刘据逃出城去，要杀了田仁。御史大夫暴胜之阻拦，说：“司直是二千石官员，即使有罪，也要先奏请皇上，怎么能说杀就杀？”刘屈氂于是释放了田仁。武帝听说了此事，大怒，派官员责问御史大夫：“司直放纵造反者，丞相要按照法律治罪，要将他斩首，你为何要阻拦？”暴胜之十分惶恐，自杀。北军监军御史任安接受了太子刘据的符节，虽然没有发兵，但武帝认为他首鼠两端，怀有二心，和田仁一起都被腰斩。侍郎莽通擒获反将如侯，长安男子景建跟随莽通捕获少傅石德，两人立下首功，莽通被封为重合侯，景建被封为德侯。大鸿胪商丘成奋力拼杀，捕获反将张光，被封为秺du侯。太子的门客，凡进入宫门的，一律斩首。跟随太子发兵的，以造反罪灭族。在混战中趁火打劫的，一律发配到敦煌郡。因太子逃出城去，武帝派兵驻守在长安各城门。又过了20几天，太子刘据在湖县被发现，自杀。

　　这个案子就是汉武帝晚年的人伦悲剧“巫蛊之祸”，是由江充制造的冤案，太子是被迫自卫还击，至于刘屈氂，他就是奉命行事而已。刘屈氂作为丞相，并未试图调解或澄清冤情，反而在武帝的命令下，率军镇压太子，他的行为虽体现对皇权的服从，但也暴露他缺乏政治远见，未能劝阻武帝的过度反应。刘屈氂作为平定叛乱的主力，没有得到封赏，显然汉武帝对刘屈氂的表现很不满意。但汉武帝也没有治刘屈氂的罪，一方面提拔刘屈氂为丞相时，汉武帝对他的能力就不抱希望，另一方面就是实在没有合适的丞相人选，只好继续将就着用，这也为刘屈氂的悲剧埋下了隐患。

　　随着太子刘据自杀，太子之位空缺。当时的汉武帝已年近70，共生有六个儿子，二子齐王刘闳已经早逝；三子燕王刘旦为亲近武帝，上书请求入宫宿卫，武帝不许；四子广陵王刘胥从小不受武帝待见；五子昌邑王刘髆是武帝最爱的女人～李夫人所生，他的舅舅貳师将军李广利正得到武帝的宠信，刘屈氂和李广利是儿女亲家，李广利的女儿嫁给了刘屈髦的儿子，因此，李广利与刘屈氂都想拥立昌邑王刘髆为太子。

　　征和三年，匈奴入侵五原和酒泉，朝廷派李广利率军征讨匈奴，刘屈氂设家宴为李广利践行，送至渭桥。李广利说：“希望您早日向皇上谏言，立昌邑王为太子。如果昌邑王被立为太子，将来继承王位，您今后还担忧什么呢？”刘屈氂答应尽力。

　　这时，审理巫蛊案的官员追查的很紧，内者令郭穰告发了刘屈氂的夫人。由于汉武帝对刘屈氂办事并不满意，经常申斥刘屈氂，刘屈氂的夫人为丈夫抱不平，在祭祀土地神时，指使巫师诅咒汉武帝，有恶毒的咒语。又说，刘屈氂与李广利共同祷告祭祀，想使昌邑王刘髆当皇帝。后经有关官员调查核实，将此案定性为大逆不道罪。汉武帝下令把刘屈氂放在载运食品的车上游街示众，然后在长安东市腰斩，刘屈氂的妻子被押到华阳街斩首示众。李广利的妻子儿女也都被捕入狱，李广利在外出征，听到消息，便投降了匈奴，其宗族全部被处死。

　　从当上丞相到被腰斩，也不过才两年时间，刘屈氂终于还是没能躲过汉武帝一朝的“丞相”魔咒。刘屈氂并没有操控储君的能力，也没有任何拥立刘髆的举动。汉武帝大权独揽，丞相只是个花架子，根本没有任何实权，哪里敢置喙储君之事。但他还是卷入了汉武帝晚年最残酷的皇权继承斗争，成为了太子集团、李广利昌邑王集团以及汉武帝本人之间博弈的棋子。在这种顶级权力斗争中，无论他怎么做，都可能难以善终。因此，刘屈氂常被视为一个悲剧性的权臣，他的故事揭示了在封建专制皇权之下，臣子“伴君如伴虎”的艰难与无常。