《第二次接触》的剧情是【堀井正美】的恩师水野博士，利用一个被称作【神眼】的探测器，前往天上的一个云团里面进行调查。根据水野博士的理论，认为有一种生活在天空的生物，叫作闪电人，而这个云团就是闪电人居住的巢穴。

　　但过去没有东西可以调查这个云团的内部，直至这个叫作【神眼】的探测器出现，水野博士才前往那里进行调查，这个就被称作是【第一次接触】。

　　而标题里的【第二次接触】，则是【堀井正美】与闪电...