失去过去 5 年记忆的青年源剑一在 2051 年的月目市过着平静的生活，而这平静生活却突然被一种名为“异生人”的怪物打破。

　　按照未来人的预言，他会在未来某一天，异生人为人类带来毁灭之时成为人类的救主，但终究不敌并被杀死。而未来人窃用异生人的时间技术将源剑一未来的武器，驱动器Deep Cyclone送回更早的过去，以期他能够阻止世界末日的到来。

　　为了保护更多人免于异生人的侵扰，他最终决定成为假面骑士 Fize，接受并改变自己与人类的未来。